MB-handleiding: Embase.com


PDF


 

Inhoudsopgave

1.     Inleiding. 2

2.     Notatie in deze tekst 3

3.     Starten en openen databank. 3

4.     Zoekacties opbouwen.. 4

4.1.      Standaardtrefwoorden EMtree; niet identiek aan MeSH.. 4

4.2.      Overlap EMbase en Medline. 4

5.     Zoeken op vrije tekst 5

5.1.      Veldcodes: PubMed en EMbase. 6

5.2.      Zoekmenu's. 7

6.     Zoeken op onderwerp. 8

7.     Weergave van de resultaten.. 11

8.     Inlezen in EndNote / RefWorks. 12

 


Heeft u opmerkingen en/of aanvullingen? Stuur deze per e-mail naar:
info.mb@erasmusmc.nl
laatste wijziging: 2009/10/06



1.       Inleiding

Inhoud
EMbase
is een bibliografische databank met literatuurverwijzingen voor de basisvakken van de geneeskunde en voor alle medische specialismen. Bevat meer Europese tijdschriften en meer farmacologische tijdschriften dan PubMed/Medline. Congresbijdragen worden als aparte records opgenomen; in PubMed alleen onder de titel van het congres.

Afgeschermd
De databank is niet vrij toegankelijk. Zij is te bereiken vanuit de afgeschermde netwerken van Erasmus MC (IP=156.83.*.*) en EUR (IP=130.115.*.*), en via de VPN-portal.

EMtree-thesaurus
Aan alle records zijn 10 tot 250 EMtree-termen toegevoegd. Dit zijn trefwoorden uit de EMtree-thesaurus, het equivalent van de MeSH Thesaurus van Medline.

EMbase.com = EMbase + Medline
EMbase.com bevat twee typen records:
1.
EMbase-records
         - records voorzien van trefwoorden uit het trefwoordensysteem EMtree-terms
         - periode begin (1974) tot enkele maanden geleden
         - records die zowel in EMbase als in Medline voorkomen, of uniek zijn voor EMbase
2. Medline-records
         - records die uniek zijn voor Medline, dus (nog) geen EMbase-record zijn
         - de MeSH-termen zijn vervangen door overeenkomende EMtree-termen

Zoekprogramma's en syntax
Niet alleen de thesauri verschillen, ook de zoekprogramma's van PubMed/Medline en EMbase.com en de syntax van opgegeven zoekregels verschillen. Daardoor is het niet (eenvoudig) mogelijk zoekregels samen te stellen die zowel in PubMed als in EMbase.com zijn toe te passen.

EMbase.com of EMbase via Ovid?
Op verzoek van velen is EMbase aangeschaft per 2008; er werd gekozen voor EMbase.com van Elsevier.
In de 2e helft van 2009 wordt getest of het eenvoudiger is om zoekacties in Medline en EMbase uit te voeren via de Ovid-software. Ovid is producent van software en (tussen)­leverancier van diverse databanken. De syntax is dan wel identiek, al blijven de thesauri verschillend.

Uw mening telt
Uw mening over EMbase is zeer welkom: mailto:info.mb@erasmusmc.nl; gebruik dit e-mailadres ook als u vragen heeft over het zoekprogramma.



2.       Notatie in deze tekst

cursief

niet vertaalde Engelse begrippen, bijv. button

'tekst'

relevante tekst in een venster, bijv. voor plaatsbepaling

onderstreept

letterlijk zo intikken (een hyperlink kunt u kopiëren en plakken)

[tekst]

te klikken regel of knop

genummerde regels

in proces uit te voeren stappen verdeeld over meer regels

=>

volgende handeling op dezelfde regel

bulleted list

alternatieven verdeeld over meer regels

/

verschillende alternatieven op dezelfde regel

=

indentiek alternatief op dezelfde regel

menu's Internet Explorer

alleen Engelse versie weergegeven


 

 

3.       Starten en openen databank

1.         Alleen te starten via het afgeschermde netwerk van Erasmus MC en EUR

       vanaf de werkplek

1.         log in op het afgeschermde netwerk van Erasmus MC of EUR

2.         ga naar Medische Bibliotheek MB-homepagina: http:/www.erasmusmc.nl/medbib

       van elders medewerkers

1.         Erasmus MC Portal => klik [Medische Bibliotheek]
of direct: VPN-portal

2.         geef personeelsnummers ("microsectienummer") en bijbehorend password

3.         klik weer [Medische Bibliotheek]

       van elders – studenten

1.         MyEUR (ERNA-VPN) => log in

2.         ga naar Medische Bibliotheek MB-homepagina: http:/www.erasmusmc.nl/medbib

2.         toegang op verschillende manieren

       rechterkolom quicklink: [02 - EMbase]

       linkerkolom: [MB-Startpagina] of rechterkolom onderste quicklink = [Alle QuickLinks] => quicklink [102 - EMbase]

       linkerkolom: [Zoek bibliografische informatie] => [Artikelen in tijdschriften] => [via EMbase] (korte handleiding) => [naar EMbase]



4.       Zoekacties opbouwen

Achtergrondinformatie over standaardtrefwoordsystemen en zoeken op onderwerp:
zie QR-SubjectSearch.

Zoekmethoden

Zoeken: 1) op woorden in de tekst (free-text search) en 2) op onderwerp (subject search, via de standaard trefwoordsystemen).
Via select boxes kunt u dat in één actie doen; EMbase tracht dan de EMtree-termen te koppelen aan de opgegeven zoekwoorden. Dat wordt term mapping genoemd. De zoekwoorden worden op de achtergrond vergeleken met lijsten met alternatieve termen (Cross References).

PubMed heeft als voordeel dat u in [Details] precies kunt zien welke zoekacties werden uitgevoerd, in EMbase ziet u alleen het eindresultaat.

EMbase heeft weer een ander voordeel: daar kan de Cross References ook in omgekeerde richting worden gebruikt, namelijk als synoniemenlijst. Als u bij [Advanced Search] de select box voor 'Search also for synonyms, explosion on preferred terminology' aanvinkt zoekt EMbase ook alle synoniemen uit de lijst met Cross References (en tevens de gekoppelde EMtree-term in explosion d.w.z. met aanhangende termen). Op de zoekregel kunt u dat ook opgeven met /syn, bijv. 'pulmonary cancer'/syn.

HINT
gebruik een Word-document om de zoekacties te kunnen voor- en nabewerken. Met copy & paste kopieert u zoekacties heen en weer tussen uw Word-document, de zoekregel in EMbase en de zoekgeschiedenis in EMbase.

4.1.         Standaardtrefwoorden EMtree; niet identiek aan MeSH

EMbase en Medline werken met overeenkomende trefwoordsystemen (resp. EMtree en MeSH). Maar er zijn verschillen, waardoor u een zoekactie in PubMed/Medline niet letterlijk kunt overnemen in EMbase, of omgekeerd. In Medline kunnen alle MeSH-trefwoorden voorzien zijn van subheadings (welke dat zijn is afhankelijk van de aard van de MeSH-term), in EMbase hebben alleen trefwoorden voor ziekten, chemische stoffen, en diverse therapieën eigen verzamelingen subheadings; daarnaast zijn er ook 'algemene EMtree-termen' die geen subheadings bevatten.
Ook PsycINFO bevat een systeem met standaardtrefwoorden, allemaal zonder subheadings.

4.2.         Overlap EMbase en Medline

Er is een grote mate van overlap tussen EMbase en Medline; hoe groot die is is afhankelijk van het onderwerp en de manier van zoeken.
Ruwweg komen 75% van de EMbase-records ook voor in Medline; ca 25% van de records zijn uniek voor EMbase. Dit geldt ook voor records in de Medline-databank: 75% zit ook in EMbase, en 25% is uniek in Medline.
Als de resultaten van twee identieke zoekacties in Medline en EMbase bij elkaar worden gevoegd en ontdubbeld is de verhouding ruwweg: 20% uniek Medline, 20% uniek EMbase, 60% zowel Medline als EMbase.
In EMbase.com zijn de unieke Medline-records al toegevoegd (althans dat heeft Elsevier getracht; of het steeds goed is gedaan is de vraag). In de unieke Medline-records zijn de MeSH-termen vervangen door de overeenkomstige EMtree-termen, zodat u nog maar met één thesaurus werkt. Volgens de EMbase-handleiding worden MeSH-termen die u als zoekwoorden opgeeft automatisch omgezet naar EMtree-termen.



5.       Zoeken op vrije tekst

De databank bevat alleen verwijzingen naar artikelen, niet de artikelen zelf. Met 'zoeken op (vrije) tekst' wordt dan ook bedoeld: in de tekst van de records (d.w.z. kaarten in de kaartenbak). En dus niet in de tekst van de volledige artikelen!

Bij zoeken op vrije tekst kunt u diverse variabelen instellen.
LET OP: als u tegelijk op vrije tekst en op onderwerp wilt zoeken (met term mapping) moet u altijd met hele woorden zoeken; net als in PubMed doorlopen afgekapte woorden met een wildcard niet het proces van term mapping!

Meervoudige termen moet u altijd tussen 'quotes' zetten, anders worden de woorden als losse begrippen gehanteerd, bijv. 'colon cancer' wordt samengehouden, terwijl colon cancer wordt geďnterpreteerd als colon AND cancer.
Als u in PubMed zoekwoorden wilt koppelen aan MeSH-termen (automatic term mapping) mag u GEEN quotes gebruiken.
"Dubbele quotes" worden automatisch omgezet naar 'enkele quotes'.

Truncatie: * of ?
Als u zoekt naar alle woorden die dezelfde woordstam hebben kunt u truncatie toepassen: geef alleen de woordstam met een wildcard op de plaats van de ontbrekende letters.
Een wildcard (joker) mag in een woord staan of aan het eind, maar niet vooraan. Er moeten ten minste twee letters voor staan. In meervoudige termen tussen quotes wordt de wildcard genegeerd.
* voor willekeurig aantal letters (ook 0)
         bijv. infarct* = infarct OR infarcts OR infarction OR infarctions OR infarcted OR ...
         bijv. sul*ur = sulphur OR sulfur (OR sulur OR sulofenur OR sultanpur)
? voor exact 1 letter
         bijv. wom?n = woman OR women
         bijv. hospitali?ation = hospitalization OR hospitalisation
PubMed kent alleen * aan het eind voor een willekeurig aantal tekens.

LET OP 1:
Term Mapping gebeurt alleen bij hele zoekwoorden; gebruik dan geen truncatie, hoogstens in de vorm: infection OR infect*.

LET OP 2:
woordstam met wildcard kan niet in een combinatie van zoektermen (phrase): dus NIET: 'heart infarct*', maar wel heart AND infarct*, danwel 'heart infarct' OR 'heart infarction"

Combineren: OR AND NOT
Het combineren van zoekwoorden en zoekacties gaat in EMbase, net als in PubMed, met OR (vereniging), AND (doorsnede), of NOT (uitsluiting).
         bijv. (vegetables OR fruit) AND (cancer OR neoplasms) AND prevention

Zoekwoorden op enige afstand van elkaar: proximity operators
Dit is een speciale phrase-operatie!
*n (n=getal) tussen zoekwoorden geeft aan dat er ten hoogste n woorden tussen de zoekwoorden mogen staan; het geheel moet wel tussen quotes
         bijv. 'heart *3 infarction'
         betekent: eerst heart, dan maximaal drie willekeurige woorden, dan infarction

LET OP 1: de volgorde van de opgegeven woorden (heart, infarction) ligt vast

LET OP 2: zet de zoekactie tussen quotes, anders gezocht als: heart AND (alle woorden eindigend op cijfer 3) AND infarction

LET OP 3: wildcard tussen quotes wordt gegeneerd


5.1.         Veldcodes: PubMed en EMbase

 

PubMed

EMbase

LET OP bij phrase

geen quotes anders geen ATM
(niet aan MeSH e.d. gekoppeld)
heart infarct

wel quotes anders apart behandeld

'myocardial infarction'

alle velden
             PM: niet in [tt] gezocht
             EM: ook in :tt gezocht

geen code of [all fields]
blood
blood[all fields]

geen code

blood

alle tekstwoorden (*=wildcard)
             PM: niet [au] [ad] [tt]
             EM: wel :au :ad :tt

[tw]
infect*[tw]

geen code

infect*

trefwoorden

met explode

plus synoniemen in tekst

zonder explode

als major topic

met subheading sh
pc=prevention and control
idem major topic
free floating subheading

Medical Subject Headings (MeSH)

[mesh]
lung neoplasms[mesh]
niet mogelijk

[mesh:noexp]
lung neoplasms[mesh:noexp]

[majr]
lung neoplasms[majr]

../sh
lung neoplasms/pc[mesh]
lung neoplasms/pc[majr]
pc[sh] = prevention and control[sh]

EMTree-terms

/exp
'lung tumor'/exp
'lung tumor'/syn

/de
'lung tumor'/de

/mj /exp/mj
'lung tumor'/exp/mj

../dm_sh
'lung tumor'/exp/dm_pc
'lung tumor'/exp/dm_pc/mj
prevention/lnk

titel

oorspronkelijke titel

[ti]
blood[ti]

[tt]
bloed[tt]

:ti
blood:ti

:tt
bloed:tt

titel + samenvatting

[tiab]
blood[tiab]

:ti,ab
blood:ti,ab

tijdschriftnaam
             lang
             kort
             issn

[jour] of [ta] of [is]
journal of biological chemistry[ta]
j biol chem[ta] of [is]
0021-9258[ta] of [is]

:jt - :ta - :is
journal of biological chemistry:jt
j biol chem:ta
0021-9258:is

volume
issue

30[vi]
10[ip]

30:vi
10:ip

1e-laatste pagina
alleen 1e pagina

kan niet

123-128 = 123[pg]

123-128:pg

123:sp

jaar

jaarreeks

2008[dp]

2001:2008[dp]

2008:py

2001-2008:py

auteur
(zonder, een, twee voorletters)

1e auteur

[au]
osterhaus ad[au]

van de vijver[1au]

niet in [tw]

:au
osterhaus a d:au

kan niet

wel in textword/

adres

erasmus[ad] AND rotterdam[ad]

niet in [tw]

erasmus:ad AND rotterdam:ad

wel in textword/

 


5.2.         Zoekmenu's

Terugkeer naar standaardzoekmenu's: klik [Home] of [Search]

Zoeken op vrije tekst, eventueel met term mapping aan EMtree-termen:
keuze uit [Quick Search] of [Advanced Search]

[Quick Search]
Hierbij zoekt u 'vrije tekstwoorden'; dat is standaard aangevuld met mapping (het vinkje kunt u verwijderen om alleen in tekstwoorden te zoeken):
[v] Extensive search (mapping aan EMtree-termen, explosion, as keyword =in vrije tekst)
U kunt aanvullen met publicatiejaren (beter [<1950] to [(dit jaar)] dan [All Years]: alleen de opgegeven reeks jaren wordt onthouden voor de volgende zoekacties (niet via VPN).

[Advanced Search]
Werkt gedeeltelijk hetzelfde als [Quick Search]: het resultaat is bij beide hetzelfde als de instellingen van periode en limits overeenkomen, en bovendien zijn aangevinkt:
[v] Map to preferred terminology (with spell check)
[v] Also search as free text
[v] Include sub-terms/derivatives (explosion search)
Extra mogelijkheid (zet sommige selecties weer uit):
[v] Search also for synonyms, explosion on preferred terminology
(dan wordt ook gezocht naar synoniemen uit de lijst met Cross References)
Bij [Advanced Search] kunt u kiezen uit meer Limits en bovendien of er in EMbase-records en/of in toegevoegde Medline-records moet worden gezocht.


6.       Zoeken op onderwerp

Voor zoeken op onderwerp (via EMtree) zijn er verscheidene menu-opties

1. in horizontaal menu: Home en Search (geven dezelfde zoekmenu's, maar andere begeleidende teksten)

1.1. [Quick Search]
is standaard aangevuld met mapping (het vinkje kunt u verwijderen om alleen in tekstwoorden te zoeken):
[v] Extensive search (mapping aan EMtree-termen, explosion, as keyword =in vrije tekst)
U kunt aanvullen met publicatiejaren (kies dan [<1950] to [(dit jaar)] en niet [All Years]: alleen de opgegeven reeks jaren wordt onthouden voor de volgende zoekacties).
U kunt hier ook zoekregels in de juiste syntax opgegeven, bijv. met veldcodes voor auteur, titel, trefwoorden.

1.2. [Advanced Search]
voor algemene standaard trefwoorden uit de EMtree-thesaurus zonder subheadings
denk aan:
- meervoudige termen met aanhalingstekens, bijv. 'heart infarction'
- meer zoektermen direct combineren met AND, OR, NOT, proximity, en haakjes voor prioriteit, bijv. (fruit OR vegetables) AND 'cancer prevention'
mogelijkheden:
a. [v] te koppelen aan EMtree-termen (mapping) (standaard aangevinkt)
b. [  ] indien gewenst: direct de opgegeven zoekwoorden zoeken als "vrije tekst"
c. [v] in de EMtree aanhangende takken meenemen bij zoeken (explosion) (standaard aangevinkt)
d. [  ] indien gewenst: inperken tot hoofdonderwerp (major focus)
e. [  ] indien gewenst: tevens synoniemen (met mapping en explosion) zoeken
(zodra e wordt aangevinkt vervallen vinkjes bij b, c en d; b en c worden automatisch gedaan voor zowel opgegeven termen als voor synoniemen en gekoppelde trefwoorden; major focus is niet meer mogelijk)
- inperken op publicatiejaren; het is handiger een periode te kiezen [<1950]-[heden] dan [All Years] (de periode wordt onthouden voor de volgende keer, maar niet via de VPN-portal)
- eventueel enkele standaard "Limits" of "More Limits"
U kunt ook hier zoekregels in de juiste syntax opgegeven, bijv. met veldcodes voor auteur, titel, trefwoorden, synoniemen met term mapping en explosie (/syn).
- keuze records: uit EMbase en/of uniek Medline
=> klik [Search]

1.3. [Drug Search]
voor chemische stoffen, met subheadings en toedieningsweg
denk aan: aanhalingstekens om meervoudige termen, bijv. 'antihypertensive agents'
mogelijkheden:
a. [v] altijd gekoppeld aan EMtree-termen (mapping) (vinkje niet te verwijderen)
b. [  ] indien gewenst: direct de opgegeven zoekwoorden zoeken als "vrije tekst"
c. [v] in de EMtree aanhangende takken meenemen bij zoeken (explosion) (standaard aangevinkt)
d. [  ] indien gewenst: inperken tot hoofdonderwerp (major focus)
- inperken op publicatiejaren; het is handiger een periode te kiezen [<1950]-[heden] dan [All Years] (de periode wordt onthouden voor de volgende keer)
- eventueel specifieke subheadings voor chemische verbindingen toevoegen
(met Ctrl-klik meer subheadings - kies OR of AND - None = allemaal)
- eventueel specifieke toedieningsweg aangeven
(met Ctrl-klik meer toedieningswegen - kies OR of AND - None = allemaal)
- eventueel enkele standaard "Limits" of "More Limits"
- keuze records: uit EMbase en/of uniek Medline
=> klik [Search]

1.4. [Disease Search]
voor ziekten, met subheadings
denk aan: aanhalingstekens om meervoudige termen, bijv. 'myocardial infarction'
mogelijkheden:
a. [v] altijd gekoppeld aan EMtree-termen (mapping) (vinkje niet te verwijderen)
b. [  ] indien gewenst: direct de opgegeven zoekwoorden zoeken als "vrije tekst"
c. [v] in de EMtree aanhangende takken meenemen bij zoeken (explosie) (standaard aangevinkt)
d. [  ] indien gewenst: inperken tot hoofdonderwerp ("major focus")
- inperken op publicatiejaren; het is handiger een periode te kiezen [<1950]-[heden] dan [All Years] (de periode wordt onthouden voor de volgende keer)
- eventueel specifieke subheadings voor ziekten toevoegen
(met Ctrl-klik meer subheadings - kies OR of AND - None = allemaal)
- eventueel enkele standaard "Limits" of "More Limits"
- keuze records: uit EMbase en/of uniek Medline
=> klik [Search]

2. in horizontaal menu: EMTREE Tool

2.1 [Find Term]
Vind alle EMtree-trefwoorden waarin het opgegeven woord zit of waarvoor dit woord een geldig alternatief is.
U heeft de mogelijkheid om de gevonden term naar bovengenoemd zoeken op onderwerp mee te nemen of in een eenvoudig zoekformulier te plaatsen.
In het eerste geval handelt u onderwerp voor onderwerp af en verfijnt ze met subheadings (ziekten, stoffen), later combineert u de onderwerpen via setnummers; in het tweede geval combineert u direct meer onderwerpen maar u kunt ze niet verfijnen met subheadings.

Bijvoorbeeld: Is aspirine veilig te gebruiken bij de preventie van hartinfarct?

1. tik bij Find Term: infarct => klik [Find]
Ga verder naar bijv. [heart infarction]
Wilt u de hele boomtak zoeken? Laat dan "[v] Explosion" zo staan
Kies met een vinkje eventueel voor [  ] As major focus (als hoofdtrefwoord)
Dan kunt u de term meenemen naar [Disease Search] om subheading [Prevention] toe te voegen (zie boven 1.4.), of alleen de term in het zoekformulier op deze pagina zetten.

2. tik bij Find Term: aspirine => klik [Find]
Ga verder naar [acetylsalicylic acid]
Dit is een eindtak; explosion is dus niet relevant (vinkje kan blijven staan)
Kies eventueel [  ] As major focus
Neem de term mee naar [Drug Search] om subheading [Adverse drug reaction] toe te voegen (zie boven 1.3.), of alleen de term in het zoekformulier toe te voegen.

3. Heeft u beide zoekacties gedaan?
Vink in het venster 'Session Results' beide zoekactie aan
Controleer of onder dat venster de radiobutton voor AND is gemarkeerd
Klik dan op [Combine].


2.2 [Browse by Facet]
Blader door de functionele boomstructuur om de gewenste EMtree-term te zoeken
Bijv. 3e regel: klik [physical diseases etc] => [physical disease by etiology etc] => [neoplasm] => [neoplasm subdivided by anatomical site] => [respiratory tract tumor] => [lung tumor] => daarna kunt u zoals in 2.1 de term meenemen naar [Disease Search] voor toevoegen van subheading [Etiology] (1.3) (zoek niet in free text) 

2.3 [Browse A-Z]
Blader door een alfabetische lijst van alle EMtree-termen die passen bij het opgegeven woord
Bijv. geef term tobacco => klik [Find] => kies bijv. [cigarette smoke] => daarna kunt u zoals in 2.1 de term meenemen naar [Drug Search] voor toevoegen van subheading [Adverde drug reaction] (1.2) (zoek niet in free text)

U kunt de zoekacties weer combineren als boven:
Vink in het venster 'Session Results' beide zoekactie aan
Controleer of onder dat venster de radiobutton voor AND is gemarkeerd
Klik dan op [Combine].

3. Andere zoekmogelijkheden achter [Home] en [Search]

3.1 [Field Search]
zoeken in bepaalde velden (bijv. titel, samenvatting); de klikbare velden eventueel via een alfabetische index

3.2 [Article Search]
zoeken van een artikel als enkele gegevens bekend zijn



7.       Weergave van de resultaten

De resultaten van de zoekacties verschijnen in twee vensters onder elkaar:

Session Results
De uitgevoerde zoekacties; er zijn maximaal zes regels zichtbaar, maar u kunt wel met een schuifbalk de rest zien.

Mogelijkheden na markeren van zoekacties
(sommige optie vereisen gratis registratie bij EMbase)
opslaan, verwijderen, E-mail Alert opzetten, afdrukken, per e-mail aan iemand opsturen, exporteren als tekstdocument|
combineren tot een nieuwe zoekactie (met AND of OR), of via Advanced ook te combineren met NOT

U kunt ook per zoekactie analyseren (verdeling van aantal artikelen per jaar), bekijken, bewerken.

Search Results
De gevonden verwijzingen (records) kunt u per stuk of in groepen selecteren voor:
uitgebreid bekijken, afdrukken, exporteren (voor opname in EndNote), per e-mail versturen, op een prikbord plaatsen.

Uitgebreid bekijken houdt in:
- klikbare link naar de volledige tekst (geen mooi systeem als PubMed-LinkOut; gewoon proberen of het lukt, anders via [Zoek MB-Journals] op MB-home)
- samenvatting
- zien welke EMtree-termen zijn toegevoegd
- Related articles lijkt een weinig zinvolle functie; enkele belangrijke termen worden in OR-combinatie gezocht.



8.       Inlezen in EndNote / RefWorks

Helaas is de uitvoer van EMbase niet gelijk aan die van PubMed/Medline, waardoor ontdubbelen van resultaten uit EMbase en PubMed niet automatisch en snel is uit te voeren. Zo staan bijvoorbeeld de namen van de tijdschriften op het scherm in korte (Medline-)vorm, maar in het geëxporteerde bestand staan de namen in volledige vorm. En zo komen ze ook in EndNote en RefWorks terecht. De paginanummers zijn hier van de vorm 123-128, in PubMed in de vorm 123-8; dat wordt in EndNote en RefWorks niet als hetzelfde herkend. Bij Elsevier is verzocht om de uitvoer hetzelfde te maken als die van PubMed, maar de reactie is niet positief.

In Embase.com
1. [_] Selecteer de over te nemen records (eventueel select first ...)
2. klik [Export]
3. Kies Export Format: [EndNote]
4. Klik [Export]
5. bij gebruik van een beveiligde Internet Explorer 8 moet dit soms twee keer gebeuren
6. kies opslaan naar het bureaublad
7. geef een naam, bijv. naam.ris
8. exporteer het bestand
Dat bestand importeert u in onze referentiedatabank.

In EndNote
1. [File] => [Import]
2. kies achter 'Import Data File:': het gedownloade bestand (naam.ris)
3. kies achter 'Import Option:': Reference Manager (RIS)
4. klik [Import]

In RefWorks
1. maak eventueel een nieuwe folder aan: [Folders] => [Create New Folder] => geef naam voor folder
2. [References] => [Import]
3. kies import-filter: [RIS Format]
4. kies databank: [RIS Format]
5. kies map om nieuwe referenties toe te voegen (moet wel al bekend zijn, zie 1.)
6. kies het bestand met de uit de databank gedownloade referenties (naam.ris)
7. klik [Import] – het kan even duren voor dit klaar is
8. [View Last Imported Folder]
9. verplaats naar nieuwe folder
          9.1. vink aan: radiobutton 'All in List'
          9.2. [Put in Folder] => kies nieuwe folder