Literatuurzoeken

Hoofdstuk 6.2: Weergeven van resultaten in PubMed


Hoofdstuk 6.1: Zoeken in PubMed 


Paragrafen Korte weergave
Uitgebreide weergave
Selectie van records
Print: afdrukken van records
Save: opslaan van records
SDI: opslaan en hergebruik van zoekacties
Korte weergave Als een zoekactie met Search is uitgevoerd verschijnen na elke zoekactie de resultaten in korte vorm (Summary) op het scherm. Werd met Preview gestart dan laat het systeem de laatste vijf verzamelingen zien (na More History alle verzamelingen). Klik dan op het aantal referenties (dit getal is als link uitgevoerd) voor de korte weergave.
De menu-functies van het resultaatscherm zijn al besproken bij het zoeken (zie aldaar).
Records per pagina

Standaard zijn het er 20. Met een klik op de op het pijltje erachter kun je dit aantal veranderen. Neem niet een te groot aantal, 100 is wel handig om in korte tijd door te bladeren. Het maximum is 500.

Direct hierachter is vermeld hoeveel referenties er in totaal zijn, om hoeveel pagina's het gaat (d.w.z. browser-schermen), en de paginanummers die als klikbare link zijn uitgevoerd.

Formaat: Summary

Eerst verschijnen de records op het scherm in het korte Summary-formaat:

  • een SelectBox o ® vink alleen de relevante records aan
  • de auteurs zijn als klikbare link uitgevoerd ® klik om ook de samenvatting van dit artikel weer te geven
  • de titel (of, bij niet Engelstalige artikelen, de in het Engels vertaalde titel)
  • het brontijdschrift (tijdschrifttitel, jaargang, aflevering, pagina's, jaar)
  • unieke identificatienummer van PubMed (PMID)
  • een hyperlink naar [Related Articles] ® verwijst naar meer dan 100 gerelateerde artikelen.
Uitgebreide weergave

Voor één referentie met samenvatting: klik de auteurs. Ga daarna met [Back] weer terug.

Er zijn verscheidene formaten voor uitgebreide weergave.
ONTHOUD: een uitgebreide weergave is nog steeds een verwijzing en geen fulltext-artikel.

Om de beschikbare formaten te zien:
1. klik het woord [Summary] achter [Display] ®
de beschikbare formaten verschijnen
2. klik het gewenste [formaat]
3. klik [Display]
(met [Text] komt dezelfde informatie zonder opmaak en zonder PubMed-menu's op het scherm te staan; is wel handig om zo te printen)
4. gebruik de schuifbalk rechts om het effect te bekijken.

Bekijk de formaten die hieronder worden genoemd.
Summary zie boven
Brief

Is extra kort:

  • selectbox
  • 1e auteur, begin van de titel, PMID
  • link naar Related Articles
  • LinkOut naar de Internet-site van de uitgever om het fulltext-artikel op te halen (is niet mogelijk als je geen toegang hebt)
Abstract
  • selectbox
  • brontijdschrift
  • LinkOut naar website van uitgever, eventueel met knop  ErasmusMC  om aan te geven dat wij toegang hebben
  • (in het Engelse vertaalde) titel
  • auteurs
  • instelling (affiliation)
  • samenvatting (abstract)
Citation
  • als Abstract-formaat, plus
  • MeSH-trefwoorden in de vorm: MeSH term/subheading* (sterretje duidt op gebruik als hoofdtrefwoord)
    zie ook: zoeken op onderwerp: Subject Search
  • chemische stofnamen
De formaten Summary, Abstract en Citation zijn nodig voor afdrukken, of voor inlezen in tekstverwerkers als Word.
MEDLINE
  • weergave van alle beschikbare velden met tweeletter-veldcodes ervoor
  • bij niet-Engelse artikelen is er ook een titel in de oorspronkelijke taal (TT = Transliterated Title)
Het Medline-formaat is nodig om de records in te lezen in database-programma's als EndNote Plus
Related Articles is geen alternatief display-formaat: alle gerelateerde artikelen (ca 100 per verwijzing) van de eventueel geselecteerde artikelen worden samengenomen in één verzameling; is soms een handige optie
andere opties zijn automatische links naar andere databanken als records de desbetreffende informatie bevatten
Selectie van records

Literatuurzoeken is een optimaliseringsproces. Het is zelden mogelijk alleen maar relevante artikelen te vinden. Er zal altijd wat 'uitschot' zijn als je probeert zoveel mogelijk relevante artikelen te vinden. Het is vaak beter om niet verder in te perken anders loop je het risico relevante artikelen kwijt te raken. Het handigste is dan om snel alle resultaten door te bladeren en aan de hand van de titel te controleren welke artikelen relevant zijn (of even naar de samenvatting te kijken door te kiezen voor: [Display Settings] > [O Abstract] > [Apply]. Dat is handiger dan op de [titel] te klikken en na het bekijken met [Back] terug te gaan naar de korte weergave). Markeer de relevante artikelen door op de selectbox (o ) te klikken. Op deze manier kost het maar enkele minuten om honderd referenties op relevantie te bekijken.

Soms kan het handig zijn om door een klik op [Display Settings] > [Items per page] > [Apply] op een ander aantal te zetten (50 of 100).

ADVIES:

Als er op een pagina één of meer records zijn geselecteerd met o : klik eerst even op [Send to] > [Clipboard] > [Add to Clipboard] alvorens door te gaan naar de volgende pagina. Op die manier komen alle relevante artikelen op een prikbord te staan; ze kunnen later in één keer worden geprint of in een bestand opgeslagen.

WAARSCHUWING 1: Als er geen records zijn geselecteerd komen alle records van alle pagina´s op het prikbord te staan.
WAARSCHUWING 2: Als je begint, kijk dan eerst even of er van de vorige keer geen records meer op het prikbord staan:
® klik [Clipbord]
® als er inderdaad records staan, klik dan [Remove all items]
Geef de laatste verzameling weer in Summary display als dat niet zo is.

Blader door de eerste pagina en selecteer zes relevante records.

Zet die op het prikbord.

Zet van de tweede pagina vijf records op het prikbord.

Het systeem onthoudt gedurende acht uur nietsdoen welke records op het prikbord staan, daarna wordt het prikbord (net als de zoekgeschiedenis) leeggemaakt. Er passen maximaal 500 records op het prikbord. Als je probeert een record dat al op het prikbord staat nog een keer erop te zetten (bijv. na een andere zoekactie) dan gaat dat niet. Overigens: in een verzameling resultaten van een zoekactie kun je zien welke records al op het prikbord staan: daarvan zijn de volgnummers groen.

Het is ook mogelijk achteraf alsnog records weer van het prikbord af te halen. Als je via de menu-optie [Clipboard] de inhoud van het prikbord weergeeft is er bovenaan een link [Remove all items] (of het aantal geselecteerde items indien een of meer records geselecteerd).

WAARSCHUWING:
Als geen records worden gemarkeerd verwijdert PubMed met [Remove all items] alle records van het prikbord!

Bekijk wat er op het prikbord staat.

Verwijder twee records van het prikbord.

Print: afdrukken van records

Bij het afdrukken gebruik je de gewone [Print]-functie van de browser (zelf gebruik ik bij voorkeur [File] => [Print Preview] ([Bestand] > [Afdrukvoorbeeld]) om eerst te zien hoe het eruit ziet. Het document dat op het scherm staat kan vele schermen en ook vele afgedrukte pagina's lang zijn. Het wordt afgedrukt in dezelfde vorm die het ook op het scherm heeft, dus inclusief de PubMed-omgeving. Door eerst een layout met de aanduiding (text) te kiezen kan ook als eenvoudige tekst zonder opmaak en zonder menu's worden geprint.

LET OP! Vaak wordt gedacht dat alleen de in de selectbox gemarkeerde records worden afgedrukt, maar dat is dus niet waar. Je kunt wel records selecteren om af te drukken, maar dan moet je eerst op [Display Settings] klikken (na eventueel een ander formaat of doellocatie te hebben gekozen). Alleen de geselecteerde artikelen komen dan op het scherm te staan en die kunnen als zodanig worden afgedrukt.
Er zijn speciale formaten om direct af te drukken:  Summary (text), Abstract (text); hierbij worden niet de MeSH-termen getoond, ook al staan die met Abstract (zonder text) wel op het scherm.
Na de keuze voor een optie met (text) kun je alleen terug met de Back-toets van de browser.

Bekijk hoe de resterende negen referenties van het prikbord er in Abstract-formaat met Display uit zouden zien als je ze zou willen afdrukken.

En hoe zien ze eruit in Text-formaat?

Save: opslaan van records in een bestand

De vorm waarin referenties worden opgeslagen is te kiezen. Welke kunnen we gebruiken?

  • voor offline-afdrukken of inlezen in een tekstverwerker:
    Summary voor Auteur - Titel - Tijdschrift
    Abstract bevat bovendien ook een samenvatting
  • Medline voor importeren in een persoonlijke databank (bijv. EndNote Plus)

Maak eventueel een selectie van relevante records; geen een geselecteerd = allemaal. Klik dan [Send to] > [O File] > een aanvullend scherm opent zich > kies [Format]: Summary(text), Abstract(text) of Medline > [Create file] > dan volgt de normale opslag-routine van Windows
(het duurt even voor de records zijn opgehaald):
- kies voor een handige disk (station) en subdirecory (folder of map), bijv. Desktop (Bureaublad), namelijk gemakkelijk terug te vinden.
- geef een zinvolle filenaam (bijv. groente&kanker1.txt),
- sla tot slot het bestand op.

Sla de gehele inhoud van het prikbord op met de voorgestelde filenaam; zorg dat behalve auteur, titel en tijdschrift ook de samenvatting erbij staat.

Doe dit nog een keer, maar kies nu voor layout Medline en sla ook op onder een aangepaste bestandsnaam.

Deze files kun je elders met Word printen. Als oefening:
Open beide files met Word en bekijk de inhoud.
Stoppen met PubMed
Sluit het browser-venster of tabblad
De zoekacties in Search History en records op het Clipboard blijven nog acht uur bewaard.

© Medische Bibliotheek Erasmus MC
17-11-2009 MB-CBI